1.Presionando el ícono de nuevo proyecto:

2. En el menu File / New Project
3. Presionando Ctrl + Shift + N.
Despues nos va a mostrar el siguiente menú del cual , como vamos a crear una aplicacion Java, logicamente seleccionamos General / Java Application.

Luego nos aparecerá la siguiente pantalla la cual llenaremos con los datos correspondientes:


Administracion de archivos y proyectos:
-Proyectos: Organizacion de los proyectos, codigo fuente de estos y librerias.

*SOURCE PACKAGES: es donde se almacenan los paquetes del codigo fuente.
*TEST PACKAGES: paquetes de prueba
*Libraries: Librerias
*Librerias de Prueba
-Archivos: Practicamente es un explorador de los archivos que se encuentran en la carpeta del proyecto.

Como sabemos, cuando una clase Java es compilada se genera un archivo .class, el cual se guarda en una carpeta llamada build, que contendra los .class, y los codigos fuente .java se guardan en la carpeta src.